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在设置加密文件系统之前，你应该随意分区，这样排除一个潜在关于磁盘内容的信息漏洞，图1示范了一个抽象的半满磁盘，它没有恰当进行随机排列，图2示范了一个恰当随机排列的磁盘，在格式化之前包含一个加密的文件系统，注意，从图1中可以获取到一些关于它的内容的知识（如它们跨越了磁盘的二分之一），图2提供了一个没有那么豪华的对手，假如这样，磁盘可以很容易被清空，分区随机排列是通过用随机数据重写它的内容实现的：dd if=/dev/urandom of=/dev/hda4，这个过程可能要花很长的时间，因为创建随机数据有些困难的。
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图1 |
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图2随机排列的分区隐藏了使用量 |
要在/dev/hda4上创建一个加密的ext3文件系统，使用下面的步骤：
1）确认aes，dm-mod，dm-crypt模块已经载入内核
2）卸载将要托管加密root文件系统的分区/dev/hda4
#umount /dev/hda4
3）创建一个随机256位加密密钥并存储在/etc/root-key
#dd if =/dev/urandom of=/etc/root-key bs=1c count=32
这个密钥稍后将拷贝到闪存盘。
4）创建一个dm-crypt设备，使用前面创建的密钥加密
#cryptsetup -d /etc/root-key create /dev/hda4
现在访问/dev/mapper/root在/dev/hda4上提供了一个加密层，默认情况下，cryptsetup创建一个aes加密的dm-crypt设备并任务密钥大小为256位。
5）在/dev/mapper/root上创建一个ext3文件系统
#mkfs.ext3 /dev/mapper/root
6）挂载新文件系统
#mkdir /mnt/encroot
#mount /dev/mapper/root /mnt/encroot
7）现在你已经有一个加密文件系统了，你必须用/dev/hda5（原始的root文件系统）的内容来填充它
#cp -ax / /mnt/encroot
8）最后，在/mnt/encroot/crypttab中创建一个条目以便不同的实用程序知道文件系统是如何配置的：
root /dev/hda4 /etc/root-key cipher=aes
现在我们的加密文件系统已经准备好了，需要理解更多关于目标架构的启动过程，通常，计算机有一个固件程序来掌管系统启动的全过程，保护固件程序超出了本文的范畴，因此我们假设系统固件程序是可以信任的，大多数读者可能对BIOS比较熟悉，它是PC平台的启动固件程序，我主要讨论的是Open Firmware，它用于计算机制造厂商如苹果，sun和IBM启动系统。
NetBSD/macppc的安装指令对Open Firmware做了一个充分的介绍，我们对使用Open Firmware命令行接口配置计算机从一个闪存盘启动非常感兴趣，Open Firmware允许你查看连接到计算机的设备和设置固件程序变量的值。
在一个新世界（G3或更新的）苹果计算机初始化启动过程中，可以通过暂停选择性命令来访问Open Firmware提示符。
变量boot-device用于确定系统将从哪个设备启动，printenv命令允许查看当前的值：
> printenv
[...]
boot-devicehd:,\\:txbihd:,\\:txbi
这实际上意味着通过执行在第一块IDE磁盘上HFS类型txbi的文件来实现启动的，第二：txbi前的字符作为解释一个HFS文件类型的标志，否则，txbi可能被理解为文件路径，假如这样，标志hd实际上是更复杂的/pci@f4000000/ata-6@d/disk@0的一个别名，这个字符串通过子系统变量表现了路径，你可以使用Open Firmware命令查看设备对应的别名。
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